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友善列印Agilent Microarray Service

服務特色

由獲得 Agilent 認證之晶片服務公司 — Welgene 所提供的專業晶片實驗分析服務,從樣品 QC 品檢、螢光標定反應、晶片選擇、雜交反應,乃至晶片結果掃瞄、影像數據分析等…,全程採用 Agilent 原廠建議之設備與實驗方法,提供給您最佳化的實驗品質與成果。並且有別於一般服務中心,本公司還提供後續實驗報告講解與生物資訊服務,讓您快速掌握實驗分析結果。


服務流程

  1. 與伯森業務或客服人員聯絡,確認服務內容與售價。
  2. 參閱頁面左方「樣品製備建議」指示,準備待測樣品。
  3. 下載填寫「樣品送件表單 Sample Submit Form」後,通知伯森業務收取服務分析樣品。送樣前,請核對送件表單中所填寫的樣品名稱與實際樣品管蓋標示是否相符。
  4. 收件後於三個工作天內將發出樣品品質檢測報告,此時會再次與您確認是否進行後續基因晶片實驗。
  5. 於確認後的三週左右將發出晶片實驗報告,並可依照您的需求提供報告講解或生物資訊服務。

服務種類

  • 基因表現晶片 (Gene Expression Microarray)
  • 微型核醣核酸晶片 (miRNA Microarray)
  • 基因體雜交比較晶片 (array Comparative Genomic Hybridization, aCGH)
  • 基因體甲基化晶片 (Methylation Microarray)
  • 染色質免疫沉澱晶片 (ChIP-on-chip)
  • 客製化晶片 (Custom Microarray)
  • 其他相關附加服務 - 核酸萃取、雷射組織切片 (Other Related Services - Nucleic Acid Extraction, LCM)

 

  • Gene Expression
  • miRNA
  • aCGH
  • Methylation
  • ChIP-on-chip
  • Custom

Gene Expression Microarray

產品特色

  • 僅需 5 µg 以上的 Total RNA,即可提供基因表現晶片實驗分析服務。
  • 採用 Agilent 專利噴墨原位合成技術 (in situ inject printing) 的 60 mer Oligo 晶片,比起一般 25 mer 形式晶片靈敏度提高 5~8 倍

Agilent 晶片種類

規格 晶片物種
8 x 60K Human、Mouse、Rat
4 x 44K Human、Mouse、Rat
Others Arabidopsis (V4)、Barley、Bovine (V2)、Brassica、Canine、Canine (V2)、C. elegans (V2)、Chicken (V2)、Cotton、Drosophila、E. coli、Horse、Magnaporthe (V2)、Medicago、Mosquito、Porcine (V2)、Rabbit、Rhesus、Rice、Salmon、Sheep、Tobacco、Tomato、Wheat、Xenopus (V2)、Yeast (V2)、Zebrafish (V3)
::: 歡迎來電洽詢更多晶片種類資訊,或參閱 Agilent 網站說明 :::

實驗流程說明

Step 1. 製備 Total RNA:依不同樣品形式進行後續處理,最終產物為 Total RNA。

樣品形式 貯存溫度 運送方式 樣品處理
Total RNA
(≧5 µg)
-80°C 乾冰 不需額外處理
Cell
(≧106 cells)
-80°C 乾冰 以 Trizol 結合 spin column 方法純化 Total RNA
Tissue
(≧20 mg)
-80°C 乾冰 以雷射擷取微組織細胞 (LCM) 的方法擷取特定均質細胞群再純化 Total RNA,或直接純化 Total RNA
Blood
(≧2.5 ml)
-20°C 乾冰 以 Trizol 結合 spin column 方法純化 Total RNA

Step 2. Total RNA 品質檢測

  • 採用 NanoDrop 進行 RNA 量、濃度與純度之測量,其靈敏度可達 5 ng/ml,受測體積僅需 1µl。
  • 以 Agilent Bioanalyzer 2100 微流體電泳系統搭配 RNA 6000 nano labchip 或 RNA 6000 pico labchip 提供符合國際期刊所需之標準值檢測,包含:28S/18S ratio 以及 RIN (RNA Integrity Number) RNA 完整度測量。
  • 需符合下列標準方可進行後續晶片實驗。
RNA amount RNA concentration OD260/OD280 28S/18S ratio RIN
≧5 µg ≧0.2 µg/µl ≧1.8 ≧1.2 ≧7

Step 3. cRNA 放大暨螢光標定反應:將樣品 RNA 合成雙股 cDNA 之後,以 In Vitro Transcription 放大合成 cRNA 同時以 Aglient Labeling 系統線性放大反應合成標定有 Cyanine 3 / Cyanine 5 -CTP 的 cRNA 樣品。(實驗原理與流程)

Step 4. 雜交反應:兩種標定的 cRNA 樣品和基因晶片進行約 17 小時之雜交反應 (hybridization)。

Step 5. 數據分析:影像分析及實驗數據結果輸出。

Step 6. 發送報告:實驗分析報告包含下列內容,其中 1~3 項將燒錄於光碟中,第 4 項則為文件形式。發送報告後,將有技術專員可提供免費報告解說服務。

  1. 影像檔案。
  2. 基因表現比值 (gene expression ratio):包含原始數據及比值 >2 或 <0.5 兩種形式。
  3. 基因註解。
  4. Microarray information (MIAME)。

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