敬邀參加 PacBio 線上講座:(3/3) Using the Iso-Seq Method For Bulk and Single-Cell Isoform Sequencing, (3/5) Long Reads vs More Reads in Microbial Community Composition

敬邀參加 PacBio 線上講座

活動簡介

PacBio 公司獨家研發的 HiFi 定序打破一般傳統第三代定序技術高錯誤率的窠臼,不僅具有長讀取特性(最長可達 25 kb)更同時提供比肩桑格定序 (Sanger seqeuncing) 的高準確度(>99.9%)!目前 HiFi 定序不僅參與了多項大型基因體計畫(例如 Darwin Tree of Life、Human Genome Reference Program、Human Pangenome Project、SOLVE-RD Project 等等),更在臨床醫學與微生物體 (microbiome) 等研究領域協助科研人員獲得許多新的發現,累積科學文獻超過 6,300 多篇。

在三月初即將登場的兩場線上講座,將為您介紹 HiFi 定序在 RNA 全長定序與轉錄體 (transcriptome) 研究的強大效能與應用實例,以及 HiFi 定序如何助力腸道微生物研究與加速益生菌治療藥物開發。內容實用豐富,歡迎您踴躍報名參加;也竭誠歡迎您在 Q&A 環節與我們共同分享討論研究問題。

中文線上講座

2021年3月3日(三), 10:00 - 11:30

Using the Iso-Seq Method For Bulk and Single-Cell Isoform Sequencing

PacBio 公司獨家研發的 RNA 全長定序技術 Iso-Seq (isoform sequencing) 兼具有高準確度 (>99.9%) 與長讀取 (~10 kb) 特性,幾乎不需組裝即可自 Iso-Seq 測序結果中直接讀取到轉錄產物 (transcripts) 的全長序列,精確地呈現各個選擇性剪接 (alternative splicing) 轉錄異構物 (transcript isoforms) 的外顯子 (exon) 組合樣貌!在最新的 Sequel IIe 定序系統上,一片SMRT Cell 8M 定序晶片、再搭配後端成熟的官方與社群開發分析工具,即足以詳盡地描繪出整個轉錄體 (transcriptome) 的完整樣貌。

透過此演講,您將會了解到:

  • Iso-Seq 定序原理
  • 應用實例:發現癌症融合基因 (fusion genes in cancers)
  • 應用實例:六倍體紅杉 (coastal redwood) 的異構物定相分析 (isoform phasing)
  • 應用實例:單細胞選擇性剪接轉錄異構物的發現與分析

講員

Elizabeth Tseng, PhD

Principal Scientist, PacBio

Elizabeth Tseng 於美國華盛頓大學取得資訊科學 (Computer Science) 博士學位。在 PacBio 公司參與多項 Iso-Seq 分析工具的開發工作,包含選擇性剪接轉錄異構物分析、開放閱讀框 (open reading frame, ORF) 預測、對偶基因專一性異構物 (allele-specific isoform) 表現分析、轉錄產物識別與鑑定等。

報名資訊

請前往活動網頁線上填寫報名表。活動相關問題請洽 PacBio 台灣代理 — 伯森生技。

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英文線上講座

2021年3月5日(五), 11:00 - 12:00

Long Reads vs More Reads in Microbial Community Composition

目前微生物體 (microbiome) 研究領域所面臨到的挑戰之一就是如何更加精確完整地解構腸道微生物?在此演講中,將透過實際案例為您展示 HiFi 定序技術如何將 16S 菌種分類的分辨率提高至「菌株」等級,並協助您以更有效經濟的方式完成微生物群落結構分析、菌種鑑定、基因功能註解、代謝途徑重組與總體基因體定序 (shotgun metagenomic sequencing) 。

透過此演講,您將會了解到:

  • HiFi 定序原理
  • 應用實例:從糞便樣本的 16S 定序結果中獲取菌株等級的腸道微菌叢分析數據
  • 應用實例:從糞便樣本的總體基因體定序結果中獲取更多功能基因資訊以及完整的總體基因體組裝基因體 (metagenomic-assembled-genomes, MAG)
  • 應用實例:HiFi 定序如何加速益生菌臨床治療藥物開發

講員

Meredith Ashby, PhD

Director, Strategic Marketing
PacBio

Jeanette Gehrig, PhD

Senior Scientist
Siolta Therapeutics

Daniel Portik, PhD

Bioinformatics Scientist II, Applications
PacBio

   

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