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全新 Nanobind® HT kits 滿足自動化 HMW DNA 萃取需求 提升高通量基因定序效率
不久前我們曾經介紹過 PacBio 公司所推出的高品質 HMW DNA 萃取試劑套組「Nanobind® HMW DNA Extraction Kits」,這系列產品不僅能夠適用在幾乎所有種類的生物樣本,更難能可貴的是它能萃取出極高品質的超長 DNA 片段,使定序讀長增加!下圖是分別使用 PacBio Nanobind CBB kit 與它牌 HMW kit 萃取人類全血 DNA 樣本,再以 PacBio HiFi 定序技術進行全基因體定序的實驗結果,可以看到 PacBio Nanobind 的確具有更加出色的產品效能。
全新 Nanobind HT kits 滿足自動化 HMW DNA 萃取需求
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PacBio 於本月初全新推出的「Nanobind HT kits」系列則是專為有高通量基因定序需求的用戶所設計,此系列產品能相容於 Hamilton NIMBUS Presto 和 Thermo Fisher KingFisher 等四款自動化核酸萃取系統,使 DNA 萃取流程自動化。以搭載 KingFisher Apex 系統為例,約 2 小時左右即可完成 96 個人類血液或細胞樣本 (200 µl/sample) 的核酸萃取實驗。下表是 Nanobind HT kits 搭配 NIMBUS Presto 或 KingFisher Apex 系統進行 DNA 萃取,再以 PacBio Sequel® IIe 定序系統進行 HiFi 全基因體定序的實驗結果。從萃取出的 DNA 品質來看,平均 DNA 長度可達到將近 100 kb,且 93% 以上的 DNA 長度都超過 10 kb (GQN score);定序數據則顯示平均定序讀長為 13–18 kb,並可產出 >35 Gb HiFi reads,顯示 Nanobind HT kits 不僅能夠滿足自動化 HMW DNA 萃取需求,更能提升高通量基因定序的效率與品質。
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