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Detecting cancer-related RNA dysregulation with long-read sequencing

過去在進行癌細胞轉錄體 (Transcriptome) 與細胞異質性 (cell heterogeneity) 研究時，往往會需要同時使用短讀取與長讀取這兩種定序技術來進行單細胞 RNA 定序 (Single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)，最主要的原因就是長讀取定序技術雖然可以捕捉到轉錄異構物 (transcript isoforms) 的完整全長序列，但因為定序深度不足，因此需要短讀取定序數據來輔佐分析。

近期，蘇黎世聯邦理工學院 Arthur Dondi 等人透過創新的串連轉錄序列方式，結合高準確度的 PacBio HiFi 長讀取定序技術，大幅增加長讀取單細胞 RNA 定序深度。透過實際分析卵巢癌病患檢體，證實此種單細胞 RNA 定序方式與生物資訊分析流程，能夠非常有效地發現全新 isoforms、鑑別出癌細胞專一性 isoforms，甚至找出短讀取定序技術難以偵測得的融合基因 (fusion gene) 突變。本次演講非常榮幸邀請到 Arthur Dondi 本人與我們分享他的最新研究成果，以及介紹如何拆解分析 PacBio 單細胞 RNA 定序數據。內容豐富，歡迎踴躍報名參加；您將可以在 Q&A 環節，提問並取得立即回覆。活動相關問題歡迎洽詢 PacBio 台灣代理伯森生技。

2023年7月6日(四) 15:00–16:00

請前往活動網頁線上填寫報名表，或洽伯森生技客服部。

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