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🔊 PacBio 生物資訊線上講座
Detecting cancer-related RNA dysregulation with long-read sequencing
過去在進行癌細胞轉錄體 (Transcriptome) 與細胞異質性 (cell heterogeneity) 研究時,往往會需要同時使用短讀取與長讀取這兩種定序技術來進行單細胞 RNA 定序 (Single-cell RNA sequencing, scRNA-seq),最主要的原因就是長讀取定序技術雖然可以捕捉到轉錄異構物 (transcript isoforms) 的完整全長序列,但因為定序深度不足,因此需要短讀取定序數據來輔佐分析。
近期,蘇黎世聯邦理工學院 Arthur Dondi 等人透過創新的串連轉錄序列方式,結合高準確度的 PacBio HiFi 長讀取定序技術,大幅增加長讀取單細胞 RNA 定序深度。透過實際分析卵巢癌病患檢體,證實此種單細胞 RNA 定序方式與生物資訊分析流程,能夠非常有效地發現全新 isoforms、鑑別出癌細胞專一性 isoforms,甚至找出短讀取定序技術難以偵測得的融合基因 (fusion gene) 突變。本次演講非常榮幸邀請到 Arthur Dondi 本人與我們分享他的最新研究成果,以及介紹如何拆解分析 PacBio 單細胞 RNA 定序數據。內容豐富,歡迎踴躍報名參加;您將可以在 Q&A 環節,提問並取得立即回覆。活動相關問題歡迎洽詢 PacBio 台灣代理伯森生技。
主講者
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主持人
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![Arthur Dondi](../img/speaker_Arthur_Dondi-1.jpg)
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Arthur Dondi
PhD student in computational biology ETH Zürich
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![Wilson Cheng](../img/speaker_Wilson_Cheng.jpg)
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Wilson Cheng
Sr. Bioinformatics Scientist, Field Application, APAC PacBio
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![Zhu Tingting, PhD](../img/speaker_Zhu_Tingting-2.jpg)
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Zhu Tingting, PhD
Bioinformatics Scientist, Field Application, APAC PacBio
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2023年7月6日(四) 15:00–16:00
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