【PacBio 線上講座】The Full-Length Transcriptomic Atlas of Human Colorectal Cancer from Single-Cell Isoform Sequencing

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The Full-Length Transcriptomic Atlas of Human Colorectal Cancer from Single-Cell Isoform Sequencing

 

演講摘要

想要精確掌握癌細胞與正常細胞在轉錄體 (Transcriptome) 層次的差異性嗎?或是希望找到具有癌症疫苗開發潛力的腫瘤新生抗原表位 (Neoepitopes)?本次演講特別邀請到沙烏地阿拉伯阿布杜拉國王科技大學 Zhongxiao Li 與我們分享他們團隊是如何:

  • 利用 PacBio RNA 定序技術進行單細胞 RNA 定序 (Single-cell RNA sequencing, scRNA-seq),建立起首個 isoforms 全長序列解析度的大腸直腸癌轉錄體圖譜
  • 鑑別出各種不同譜系、亞群的表皮細胞專一性 isoforms
  • 結合全長 isoforms 與質譜資料庫數據,開發出能夠比對找出腫瘤新生抗原表位的演算法,並最終找到一組常見於大腸直腸癌患者的新生抗原表位,有望發展為大腸直腸癌的通用型癌症疫苗

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講員

主講者

主持人

Zhongxiao Li

Zhongxiao Li

PhD student in Computer Science, Structural and Functional Bioinformatics Group (SFB)
King Abdullah University of Science and Technology (KAUST)

Zuwei Qian

Zuwei Qian

Director of Marketing, APAC
PacBio

Minning Chin

Minning Chin

Staff Scientist, FAS, APAC
PacBio

   

Jonathan Bibliowicz, PhD

Jonathan Bibliowicz, PhD

Associate Director, Oncology and Cancer Research
PacBio

   

Xingliang Liu

Xingliang Liu

Bioinformatics Scientist II, Field Application, APAC
PacBio

   

活動時間

2023年8月14日(一) 14:00–15:00

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