基因表現晶片服務樣本製備建議
Gene Expression Microarray Service 可接受的樣本形式有:Total RNA、Cell、Tissue、Blood 四種,以下分別介紹其建議的樣本製備流程。若有任何疑問,歡迎隨時與我們聯繫。
Total RNA
- 樣本需求量:≥5 µg
- 濃度需求:≥0.2 μg/μl
- 品質需求:OD260/OD280 1.9~2.1
- 注意事項:請將樣本溶於 DEPC-H₂O 或 RNase-free H₂O 中,並將樣本保存於 -80°C 等待收件。送件時請隨附電泳圖,可以採用 1% denaturing agarose gel 電泳分析 28S rRNA 及 18S rRNA 的長度分布,其中 28S rRNA 的電泳位置 ~4.5 kb,18S rRNA 的電泳位置 ~1.9 kb。
Cell
- 樣本需求量:≥10⁶ cells
- 貼附型細胞製備流程:準備 10⁶ 個細胞,倒除培養液後不需 PBS 沖洗,直接加入 Trizol reagent (Invitrogen #15596-018; 10cm petri dish 約加入 3ml Trizol reagent),將細胞溶解後保存於 -80°C 等待收件。
- 懸浮型細胞製備流程:約 5~10 x 10⁶ 個細胞加入 1ml Trizol reagent,將細胞溶解後保存於 -80°C 等待收件。
Tissue
- 樣本需求量:20 mg
- 液態氮保存法製備流程:準備 20mg 的組織塊,大小約 0.5cm x 0.5cm x 0.5cm,先置於液態氮中快速冷凍,再將樣本放入專門存放液態氮的冷凍小管中 (請儘量使用抗凍冷凍小管),再保存於液態氮筒中等待收件。
- RNAlater 保存法製備流程:準備 20mg 的組織塊,大小約 0.5cm x 0.5cm x 0.5cm,置於 1ml RNAlater 中於 4°C 儲存隔夜,再轉置保存於 -20°C 中等待收件。
- 注意事項:組織離開活體後請於 30 分鐘內保存於液態氮或 RNAlater 中,同時請提供 20mg 的組織即可,因組織塊若過大會不易自管中取出,使得操作時間拉長、或造成 RNAlater 滲透時間拉長,這些都有可能造成組織中的 RNA 降解 (degradation)。
Blood
- 樣本需求量:2.5 ml
- 製備流程:建議使用 PAXgene™ Blood RNA System (PreAnalytiX GmbH) 採集血液,詳細流程請參照原廠指示說明。採集於 PAXgene™ Blood RNA Tube 中的血液樣本可保存於 -20°C 中等待收件
- 所需採血裝置:PAXgene™ Blood RNA Tube、真空採血器、真空採血針、真空血液採集管 (作為 "Discard Tube",BD Vacutainer Plus Plastic Serum Tube with Increased Silica, 13x75 mm, 4.0 ml)、酒精棉片、止血帶。