💊 PROTACs 藥物開發工具
E3 Ligase Binding Assay Kits
巧妙的 PROTACs 藥物作用原理(圖 1) 泛素-蛋白酶體系統 (ubiquitin-proteasome system, UPS) 是真核生物維持細胞內蛋白質恆定 (protein homeostasis) 的一個重要機制,用來消除錯誤折疊、損壞和磨損的蛋白質。在此機制中,有待被分解回收的蛋白質會在 E1、E2、E3 三種酵素的順序作用下連接上泛素 (ubiquitin),使其能被 26S 蛋白酶體 (26S proteasome) 辨識與降解 [1-3]。在泛素化 (ubiquitination) 過程中,E3 連接酶 (E3 ligase) 肩負著辨識目標蛋白質以及將 E2 酵素所攜帶的泛素轉移銜接至目標蛋白質的重要功能。蛋白水解靶向嵌合體 (proteolysis targeting chimeras, PROTACs) 藥物的設計原理即是透過兩個分別能夠和 E3 連接酶以及目標蛋白質 (protein of interest, POI) 結合的配體 (ligands),使 E3 連接酶得以靠近目標蛋白質並將其標記上泛素,如此一來就能巧妙地利用細胞本身的 UPS 機制消除掉特定的疾病相關蛋白質,達到治療效果 [1, 3-5]。
圖 1﹑PROTACs 藥物作用原理示意圖。 IMAGE © Cancers (Basel). 2021 Jun 20;13(12):3079 [1].
尋找更多可用的 E3 連接酶與配體,以擴展 PROTACs 藥物的多元性與有效性 自從 Sakamoto 等人在 2001 年首度證實 PROTACs 藥物概念的可行性後,迅速地在癌症、自體免疫疾病、神經退化性疾病與病毒傳染病等多種疾病治療領域蓬勃發展。例如由 PROTACs 技術巨擘 Craig Crews 教授所創立的生技公司 Arvinas,目前就有兩種口服型 PROTAC 藥物進入臨床二期,分別是用於治療荷爾蒙療法治療失效後的轉移性攝護腺癌 (metastatic castration-resistant prostate cancer, mCRPC) 的 “ARV-110”,以及用於治療 ER+/HER2- 轉移性乳癌的 “ARV-471”,對 PROTACs 藥物研發界來說極具指標意義 [6, 7]。值得一提的是,目前絕大部分開發中的 PROTACs 藥物都是以 Cereblon (CRBN) 或 Von Hippel-Lindau (VHL) 這兩種 E3 連接酶作為藥物設計基礎,然而人體中其實有超過 600 種以上的 E3 連接酶,尋找更多可用的 E3 連接酶與配體,將有助於擴展 PROTACs 藥物的多元性與有效性,甚至研製出能夠專一性作用於特定組織或細胞的 PROTACs 藥物 [1, 4, 6, 8]。
Revvity 公司旗下 Cisbio 研發團隊以專利 HTRF® 技術開發出多款 E3 Ligase Binding Assay Kits,包含 CRBN、cIAP1 (BIR2 domain)、cIAP1 (BIR3 domain)、MDM2,具有簡易的全均質化實驗流程以及靈敏穩定的偵測效能,能夠幫助您精確快速地完成 E3 連接酶結合配體的高通量篩選 (high throughput screening, HTS),提高 PROTACs 藥物研發效率!以下為您介紹 HTRF E3 Ligase Binding Assays 的檢測原理、實驗流程、產品效能與訂購資訊。
以 HTRF 技術快速篩選出 E3 連接酶的結合配體 (E3 ligase ligands)
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HTRF E3 Ligase Binding Assays 檢測原理(圖 2) 以 HTRF MDM2 Binding Kit 為例,GST 標定的人類 MDM2 蛋白質會被標定有供體螢光 Eu cryptate 的 GST 專一性抗體 (Anti-GST Eu3+ antibody) 所辨識,並與標定有受體螢光 Red 的配體 MI-1061 (MI-1061-Red) 結合,使供體螢光與受體螢光間的距離得以拉近。在 317 nm 光源激發下,供體螢光所發出的能量 (620 nm) 將可轉移至鄰近的受體螢光,激發其產生 665 nm 螢光訊號。若待測藥物能夠與 MDM2 結合,就會與 MI-1061-Red 產生競爭,造成 HTRF 訊號下降,最終可藉由 Ki 數值判斷藥物的結合能力,篩選出候選藥物進行後續確效試驗。
圖 2﹑HTRF HTRF MDM2 Binding Kit 檢測原理示意圖。
實驗流程(圖 3) 以 HTRF MDM2 Binding Kit 為例,僅需在 96-well 或 384-well 微量多孔盤孔洞中依序加入待測藥物(或標準品)、GST 標定的人類 MDM2 蛋白質、以及 HTRF 偵測混合液 (Anti-GST Eu3+ antibody + MI-1061-Red),於室溫下靜置反應 1 小時後即可進行訊號偵測。訊號可穩定維持 48 小時,讓實驗排程更彈性便利。
圖 3﹑HTRF MDM2 Binding Kit 實驗流程示意圖。
產品效能(圖 4) 使用 HTRF MDM2 Binding Kit 檢測四種藥物,其中以 AMG-232 表現出最佳的 MDM2 結合能力,其次為 Nutlin-3a 與 MI-773;Lenalidomide 則是已知的 CRBN 配體,完全不會與 MDM2 結合。此實驗結果與過去的文獻報導相符,顯示 HTRF E3 Ligase Binding Assay Kits 的確能夠精確地檢測出各種藥物對特定 E3 Ligase 的結合能力差異。
圖 4﹑HTRF MDM2 Binding Kit 產品效能。
HTRF E3 Ligase Binding Assay Kits
HTRF PROTAC Binding Assay Kits
Product Name |
POI |
E3 |
Pack Size |
Cat. No. |
BCL-XL/CRBN PROTAC Binding Assay Kit |
BCL-XL |
CRBN |
500 tests |
63ADK000CB37PEG |
10000 tests |
63ADK000CB37PEH |
BCL-XL/VHL PROTAC Binding Assay Kit |
BCL-XL |
VHL |
500 tests |
63ADK000CB38PEG |
10000 tests |
63ADK000CB38PEH |
BRD4/CRBN PROTAC Binding Assay Kit |
BRD4 |
CRBN |
500 tests |
63ADK000CB31PEG |
10000 tests |
63ADK000CB31PEH |
BRD4/VHL PROTAC Binding Assay Kit |
BRD4 |
VHL |
500 tests |
63ADK000CB32PEG |
10000 tests |
63ADK000CB32PEH |
KRAS-G12C/VHL PROTAC Binding Assay Kit |
KRAS-G12C |
VHL |
500 tests |
63ADK000CB30PEG |
10000 tests |
63ADK000CB30PEH |
近期將陸續新增更多 E3 Ligase 與 PROTACs 研究試劑,完整產品資訊與技術支援服務,歡迎洽詢 Cisbio 台灣代理 — 伯森生技。也非常歡迎隨時找我們一同交流討論 PROTACs 藥物研發與高通量篩選的各種疑難雜症與實驗問題喔~(👨💻伯森業務專員聯絡資訊)
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References
- LaPlante G, Zhang W. Targeting the Ubiquitin-Proteasome System for Cancer Therapeutics by Small-Molecule Inhibitors. Cancers (Basel). 2021 Jun 20;13(12):3079. PMID: 34203106
- Gong B, et al. The Ubiquitin-Proteasome System: Potential Therapeutic Targets for Alzheimer's Disease and Spinal Cord Injury. Front Mol Neurosci. 2016 Jan 26;9:4. PMID: 26858599
- Bricelj A, et al. E3 Ligase Ligands in Successful PROTACs: An Overview of Syntheses and Linker Attachment Points. Front Chem. 2021 Jul 5;9:707317. PMID: 34291038
- Ishida T, Ciulli A. E3 Ligase Ligands for PROTACs: How They Were Found and How to Discover New Ones. SLAS Discov. 2021 Apr;26(4):484-502. PMID: 33143537
- PROTAC® Degraders. Arvinas, Inc.
- He M, Lv W, Rao Y. Opportunities and Challenges of Small Molecule Induced Targeted Protein Degradation. Front Cell Dev Biol. 2021 Jun 22;9:685106. PMID: 34249939
- Pipeline. Arvinas, Inc.
- Cecchini C, et al. From Conception to Development: Investigating PROTACs Features for Improved Cell Permeability and Successful Protein Degradation. Front Chem. 2021 Apr 20;9:672267. PMID: 33959589
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