【TME 專題】從蛋白表現走向功能解析:Navinci Omni 開啟 TME 空間相互作用體學研究(Spatial interactomics)

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— 從蛋白表現走向功能解析 —
Navinci Omni 開啟 TME 空間相互作用體學(Spatial interactomics)研究

想知道腫瘤微環境中,哪些細胞正在互動、哪些訊號正在被啟動嗎?

Omni multiplex isPLA 讓研究者不只看見蛋白質「在哪裡」,更能在組織原位解析蛋白質交互作用、磷酸化狀態與多重蛋白標的,協助深入理解腫瘤微環境(TME)中的免疫檢查點作用、訊號傳遞與治療反應。

▲ 技術優勢

Navinci Omni 採用多重原位鄰近連接分析(multiplex in situ proximity ligation assay, misPLA)技術,透過抗體–寡核苷酸探針、鄰近連接與滾環擴增,在組織中產生可視化訊號,讓蛋白功能與分子網絡能在空間脈絡下被觀察。

misPLA (multiplex isPLA) 技術原理

↑ 圖 1| misPLA (multiplex isPLA) 技術原理:抗體–寡核苷酸探針與相鄰蛋白標的結合後,透過鄰近連接(proximity ligation)與滾環擴增(rolling circle amplification)產生局部可視化訊號,使蛋白質交互作用或修飾狀態能在組織原位被偵測。(圖片來源: DOI: 10.1101/2025.07.11.662357)

為什麼選擇 Navinci Omni?

傳統 IHC 與免疫螢光多著重於表現量與定位;Navinci Omni 則進一步提供功能性空間資訊,協助研究者判讀「哪些分子正在互動」、「哪些訊號路徑正在被啟動」,以及「這些事件發生在腫瘤組織的哪個位置」。

▲ 適合用於...

腫瘤微環境分析、免疫檢查點交互作用、MAPK 訊號路徑、TCR/BCR 免疫分型、治療前後反應比較,以及有限 FFPE 或冷凍切片樣本中的多標的分析。

TME 空間相互作用體學應用架構

↑ 圖 2|TME 空間相互作用體學應用架構:透過 multiplex isPLA,研究者可在同一張組織切片中觀察腫瘤細胞訊號、免疫檢查點交互作用與免疫細胞活化狀態,進一步建立以空間位置為基礎的功能性解讀。(圖片來源: DOI: 10.1101/2025.07.11.662357)

Omni 產品與服務亮點

  • 看見功能,而不只是表現:同時偵測蛋白質交互作用、磷酸化狀態與多重蛋白標的。
  • 客製化多重分析:可依研究需求設計最高 9-plex 自訂 panel,並從已驗證標的中自由搭配。
  • 可選擇試劑盒或代工服務:可於實驗室自行操作,也可委託 Navinci 專家執行染色與資料產出。
  • 聚焦熱門研究領域:涵蓋 MAPK signaling、immuno-oncology 與 TCR/BCR immune profiling。
  • FFPE 與冷凍切片皆可應用:保留組織形態與空間脈絡,適合珍貴樣本分析。

Omni custom service 與資料產出流程

↑ 圖 3|Omni custom service 與資料產出流程:研究者可從 Navinci verified targets 中選擇最多9組抗體配對,並由 Navinci 專業科學家於組織中完成 multiplex isPLA、影像擷取與空間訊號分析,形成可用於後續生物學解讀的資料。

▲ 從設計到資料產出,一站式支援

研究者可選擇客製化 Omni kit,或透過 Omni Service 由原廠專家協助完成實驗、影像擷取與空間訊號分析,讓團隊能更專注於生物學發現。

推薦應用情境

  • 免疫檢查點研究:觀察 PD-1/PD-L1 等分子交互作用與免疫抑制機制。
  • 治療反應與抗藥機制:追蹤治療前後功能性訊號變化,協助探索反應差異。
  • MAPK 訊號路徑:比較不同腫瘤區域中的訊號活性與腫瘤異質性。
  • TCR/BCR 免疫分型:解析免疫細胞活化狀態與受體相關訊號。

▲ 參考資料

Spatial mapping of proteins and their activity states in cancer models by multiplex in situ PLA. DOI: 10.1101/2025.07.11.662357

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