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🧬 HMW DNA 萃取最佳選擇
Nanobind® PanDNA kit
單一 Kit 即可泛用於多種樣本
近期定序技術龍頭 PacBio 發表了其最新開發的高分子量 DNA (HMW DNA) 萃取產品【Nanobind® PanDNA kit】。PanDNA kit 巧妙地將原先針對不同類型樣本的萃取技術整合為單一 Kit,可高效便利地自培養細胞、細菌、全血、組織、植物細胞核以及昆蟲樣本中萃取出高品質的超長 DNA 片段,為您的定序實驗打下良好基礎!
流程簡單快速,1~2.5 小時內即可完成實驗
PanDNA kit 獨有的試劑配方能游刃有餘地充分裂解各種不同類型樣本。而在樣本裂解後,DNA 將與 Nanobind 磁碟結合,Nanobind 可保護 DNA 減少剪切應力斷裂損傷情形,最大程度保留 DNA 長度,從而確保有效獲取 HMW DNA。最終可搭配使用 Short Read Eliminator (SRE)* 去除 <10 kb 的短片段序列,進一步提升 DNA 完整性。 *需另購
實驗證實,無論是哪種類型樣本 PanDNA kit 皆能萃取出高品質的 HMW DNA 為定序實驗打下良好基礎!
下表為 PanDNA kit 的實際實驗數據。可發現無論是哪種類型樣本,皆能獲得 4–16 µg 且長於 100 kb(昆蟲為 65 kb)的 DNA 萃取產物。接著以 Revio™ 系統進行定序,每片 SMRT Cell 可獲得平均 103 Gb 的 HiFi Data,平均讀長為 15–17 kb。
HiFi data yield from DNA sheared to 18–20 kb and size selected with the PacBio SRE kit. HiFi sequencing was performed on the Revio system with 225 pM loading and a P1 metric of 60–72%. HiFi data was analyzed with SMRT Link v13.0.
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