PacBio

Sequence with Confidence

PacBio 於 2004 年在美國加州成立，其獨家開發的「單一分子即時定序 (Single Molecule, Real-time Sequencing，以下簡稱 SMRT 定序技術)」不僅能夠提供長達數十 kb 的精確定序結果，更能完整檢測過去 NGS (next-generation sequencing) 次世代定序技術難以攻克的重複序列區域，例如：端粒 (telomeres)、著絲粒 (centromeres)、高 GC 含量區域以及複雜基因區域 (如 HLA 基因) 等，使生命科學家們得以對基因體 (genomes)、轉錄體 (transcriptomes) 與表觀基因體 (epigenomes) 有更全面完整的了解。

迄今為止已有數千篇學術期刊論文使用 PacBio SMRT 定序技術推動生物醫學、動植物與微生物等科學領域的研究發現，其應用包含全基因體定序 (whole genome sequencing, WGS)、基因變異偵測 (variant detection)、RNA 全長定序 (RNA sequencing)、複雜群體基因定序 (complex populations)、標靶基因定序 (targeted sequencing) 與表觀遺傳 (epigenetics) 修飾偵測等。

數千篇學術發表文獻採用 PacBio SMRT 長讀取定序技術。其中有多篇刊載於《Cell》、《Nature》、《Science》、《Nature Genetics》和《Genome Research》等國際頂尖期刊，您可以在此查詢到所有 PacBio SMRT 定序技術的相關文獻。

以下為您介紹 PacBio 長讀取定序 (long-read sequencing) 技術「HiFi 定序」與短讀取定序 (short-read sequencing) 技術「SBB 定序」。若您有興趣進一步了解實驗實踐細節與生物資訊分析流程，歡迎洽詢 PacBio 台灣代理伯森生技。

HiFi 定序技術

HiFi (High Fidelity) 定序技術是基於 SMRT 定序技術所開發出的高精準度長讀取定序技術，也是目前市場上唯一同時兼具 >99.9% 高準確度與 10–25 kb 長讀取定序能力的定序技術。PacBio HiFi 定序憑藉其獨樹一格的高準確度與長讀取雙重優勢，在各項大型基因體計畫中均作出重要貢獻，參與計畫包含 NHGRI Human Genome Reference Program、Telomere-to-Telomere Consortium、Human Pangenome Project、All of Us、SOLVE-RD 等；而在最新的 precisionFDA Truth Challenge V2 挑戰賽中，HiFi 定序技術也脫穎而出，無論是在全基因體、重複序列區域或 MHC 基因區域，HiFi 定序技術皆具有最佳的變異檢測準確度與結果再現性。

HiFi 定序技術的出現，意味著我們可以在享有長讀取定序技術優勢的同時，還能擁有堪比 NGS 等級的序列精準度，讓 DNA 與 RNA 序列分析工作變得更快且更加完整精確！

HiFi 定序優勢與特點：

兼具 99.9% 高準確度與長達 25 kb 的長讀取定序能力，可深入過往 NGS 難以檢測的重複序列區域，取得清晰完整的定序結果
更精確地發現各種基因序列變異，包含單一核苷酸變異 (SNV)、插入缺失 (indel) 與大片段結構變異 (SV)，其檢測錯誤率比 Oxford Nanopore 少了 21 倍、比 Illumina 少 6 倍 (根據 precisionFDA 挑戰賽 SNV + indel + SV 結果)
可直接捕捉到轉錄異構物 (transcript isoforms) 的完整全長序列，應用於轉錄體與細胞異質性 (cell heterogeneity) 研究
可直接取得 5-甲基胞嘧啶 (5mC) 定序結果，應用於表觀基因體研究

HiFi 定序原理：在進行 HiFi 定序時，待測 DNA 序列兩端會先銜接上一段序列 (adapter) 使其形成環狀 DNA。透過 PacBio 定序系統獨有的循環共識定序模式 (circular consensus sequencing, CCS)，待測 DNA 將會被反覆測序。由於 PacBio 定序技術不具有系統性錯誤，因此可以藉由比對反覆測序的序列結果將隨機產生的定序錯誤加以修正，並保留下真正的基因體變異數據，最終達到 >99.9% (Q30) 的高準確度。 HiFi 定序介紹短片 (中文字幕)

HiFi 高精準長讀取定序系統

Sequel^® IIe 定序系統 — 能讓您直接取得高品質的 HiFi 定序數據。新版分析軟體「SMRT Link 11」還可讓使用者在不更動原有實驗步驟（無須亞硫酸鹽處理）與數據處理流程的前提下，從原本的 HiFi 定序數據中額外獲取 5-甲基胞嘧啶 (5mC) 的定序結果，擴展您研究應用於表觀基因體的可能性

Revio™ 定序系統 — 全新推出的「Revio 長讀取定序系統」HiFi 定序通量比 Sequel IIe 系統提高了 15 倍，相當於每年可完成 1,300 個人類全基因體定序。搭載有 Google DeepConsensus，數據運算能力比 Sequel IIe 系統提高 20 倍，能將定序時間縮短至 24 小時完成，同時省下 50% 數據儲存空間與成本，幫助您實現高通量、高效率與高性價比的基因定序

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Nanobind^® 系列產品能適用在幾乎所有種類的生物樣本，萃取出極高品質的超長 DNA 片段。還可進一步搭配 Short Read Eliminator (SRE) 使用，以去除短片段 DNA，增加定序讀長

SBB 定序技術

SBB (Sequencing by binding) 定序技術使用未經修飾、原生態的核苷酸進行延伸，不需切除螢光也不會殘留分子疤痕，使定序結果訊噪比得以有效提升，因此能夠檢測得到其他 NGS 定序平台難以發現的罕見變異，同時還能進入先前被認為難以透過短讀取定序技術解析的基因區域，以前所未有的定序精準度為生物醫學研究帶來更多新的發現與可能性。